貴州茅台向來矜貴，前廉政專員湯顯明喜愛以之宴請大陸官員，連中國國家主席習近平訪美時亦專程開了一瓶茅台酒與奧巴馬祝酒，可見其中國「國酒」的地位。然而，據《蘋果日報》報道，釀造茅台酒的水源的污染問題十分嚴重，

較早前有大陸傳媒發現貴州茅台釀酒廠當地的唯一水源赤水河受到污染，但上周貴州茅台的董事會秘書樊寧屏於業績發佈會中指赤水河的水質合乎標準。《蘋果日報》早前派記者到貴州仁懷市的茅台酒廠實地調查，發現原來污染問題極嚴重。

據報道，赤水河兩岸布滿幾百家大大小小的酒廠，該些酒廠均直接將在釀酒過程中產生的工業污水，未經處理而直接排到河裡，污水亦令赤水河傳出一陣濃烈的惡臭。報道指貴州茅台酒廠更是赤水河污染的源頭，酒廠各個生產車間均不斷將污水排到河裡。當地居民指赤水河早就沒有魚了，更表示不會飲用河水。他們更打趣道，可能喝茅台的人都喜歡那股特殊的河水味道，酒廠才會以赤水河的河水來釀酒。雖然仁懷市政府於數年前要求茅台酒廠正視赤水河污染問題，近日更成立環境保護法庭及召開環境保護工作現場會等，但污染問題仍然嚴重。

另外，貴州茅台向來標榜自己為「有機綠色」產品，並通過驗證，但早前亦有大陸傳媒發現位於魯班鎮的高粱生產基地有濫用農藥之嫌。據報道，當地的農民均有使用農藥的習慣，而鎮上亦有多間農藥店，所謂的「有機綠色」產品看來只是宣傳的手法。

《蘋果日報》指記者曾在赤水河多處河段抽取河水樣本，打算帶回香港作化驗之用，但有關採訪驚動了公安部門，記者更被20多名公安及宣傳部人員扣押，問話近10小時，並被「要求立即離開」。而記者所抽取的河水樣本，以及收集的農藥樣品，均被公安沒收。